Giải trình tự là gì? Các công bố khoa học về Giải trình tự
Giải trình tự là một quá trình tư duy và trình bày các ý kiến, lập luận hoặc thông tin một cách logic, rõ ràng và dễ hiểu để thuyết phục người nghe hoặc độc giả...
Giải trình tự là một quá trình tư duy và trình bày các ý kiến, lập luận hoặc thông tin một cách logic, rõ ràng và dễ hiểu để thuyết phục người nghe hoặc độc giả. Khi giải trình tự, người nói hoặc viết phải sắp xếp các ý kiến hoặc thông tin một cách có cấu trúc, tuân thủ các quy tắc của logic và trình bày một cách mạch lạc, liền mạch để người nghe hoặc độc giả có thể theo dõi và hiểu rõ ý muốn của người nói hoặc viết. Quá trình giải trình tự thường liên quan đến việc sử dụng các phương pháp và kỹ năng như lập kế hoạch, phân loại ý kiến, triển khai lập luận, sắp xếp thông tin, đưa ra ví dụ và kết luận.
Trình tự giải trình là quá trình tư duy và biểu đạt các ý kiến, lập luận hoặc thông tin một cách có hệ thống và logic. Nó bao gồm các bước như lên kế hoạch, thu thập thông tin, phân loại ý kiến, xác định lập luận chính, đưa ra ví dụ và kết luận.
Quá trình của giải trình tự thường bắt đầu bằng việc lên kế hoạch, trong đó người nói hoặc viết xác định mục tiêu và cấu trúc cho thông điệp của mình. Kế hoạch này giúp người nói hoặc viết tổ chức ý kiến và thông tin một cách logic và có trình tự.
Sau đó, người nói hoặc viết tiến hành thu thập thông tin và phân loại các ý kiến, lập luận hoặc thông tin. Điều này đòi hỏi khả năng triển khai lập luận một cách rõ ràng và mạch lạc, sử dụng các bằng chứng và ví dụ để hỗ trợ những quan điểm đã đề ra.
Tiếp theo, người nói hoặc viết sắp xếp các ý kiến và thông tin theo một trình tự logic và có cấu trúc. Cái này thường được thể hiện qua sự xuất hiện của các đoạn văn, câu chuyện hoặc đoạn văn bản được phân đoạn theo từng ý chính và được kết hợp để tạo nên một sự kết nối mạch lạc và trôi chảy.
Sau đó, người nói hoặc viết sử dụng ví dụ cụ thể để minh họa ý kiến và lập luận của mình. Các ví dụ này giúp người nghe hoặc độc giả hình dung và hiểu rõ hơn về những quan điểm được đề cập.
Cuối cùng, người nói hoặc viết kết luận tổng kết những điểm quan trọng đã được trình bày và đưa ra nhận định hoặc tóm tắt cuối cùng về vấn đề được thảo luận.
Quá trình giải trình tự đòi hỏi sự rõ ràng, logic và mạch lạc trong việc trình bày ý kiến và thông tin. Nó giúp người nói hoặc viết xây dựng được một quan điểm mạnh mẽ và thuyết phục người nghe hoặc độc giả.
Danh sách công bố khoa học về chủ đề "giải trình tự":
Các dự án giải trình tự DNA thế hệ tiếp theo (NGS), chẳng hạn như Dự án Bộ Gen 1000, đã và đang cách mạng hóa sự hiểu biết của chúng ta về sự biến dị di truyền giữa các cá nhân. Tuy nhiên, các tập dữ liệu khổng lồ được tạo ra bởi NGS—chỉ riêng dự án thí điểm Bộ Gen 1000 đã bao gồm gần năm terabase—làm cho việc viết các công cụ phân tích giàu tính năng, hiệu quả và đáng tin cậy trở nên khó khăn ngay cả đối với những cá nhân có kiến thức tính toán phức tạp. Thực tế, nhiều chuyên gia gặp phải giới hạn về quy mô và sự dễ dàng trong việc trả lời các câu hỏi khoa học bởi sự phức tạp trong việc truy cập và xử lý dữ liệu do những máy này tạo ra. Trong bài báo này, chúng tôi thảo luận về Bộ công cụ Phân tích Bộ Gen (GATK) của chúng tôi, một khung lập trình có cấu trúc được thiết kế để tạo điều kiện thuận lợi cho sự phát triển của các công cụ phân tích hiệu quả và đáng tin cậy dành cho các máy giải trình tự DNA thế hệ tiếp theo sử dụng triết lý lập trình hàm MapReduce. GATK cung cấp một bộ mẫu truy cập dữ liệu nhỏ nhưng phong phú, bao trùm hầu hết các nhu cầu của công cụ phân tích. Việc tách biệt các tính toán phân tích cụ thể khỏi hạ tầng quản lý dữ liệu chung cho phép chúng tôi tối ưu hóa khung GATK về độ chính xác, độ ổn định, và hiệu quả CPU và bộ nhớ, cũng như cho phép phân giải song song bộ nhớ chia sẻ và phân tán. Chúng tôi nhấn mạnh các khả năng của GATK bằng cách mô tả việc triển khai và ứng dụng các công cụ đáng tin cậy và dung nạp quy mô như máy tính phủ và gọi đa hình đơn nucleotide (SNP). Chúng tôi kết luận rằng khung lập trình GATK cho phép các nhà phát triển và nhà phân tích nhanh chóng và dễ dàng viết các công cụ NGS hiệu quả và đáng tin cậy, nhiều công cụ trong số đó đã được tích hợp vào các dự án giải trình tự quy mô lớn như Dự án Bộ Gen 1000 và Atlas Bộ Gen Ung thư.
Quá trình tự thực (autophagy) là một hệ thống phân giải nội bào, có nhiệm vụ vận chuyển các thành phần trong bào tương đến lysosome. Mặc dù đơn giản, nhưng những tiến bộ gần đây đã chứng minh rằng tự thực đóng một vai trò rất đa dạng trong cả sinh lý và bệnh lý, đôi khi rất phức tạp. Tự thực bao gồm một số bước liên tiếp: bao bọc, vận chuyển tới lysosome, phân giải và sử dụng sản phẩm phân giải - và mỗi bước này có thể thực hiện các chức năng khác nhau. Trong bài tổng quan này, quá trình tự thực được tóm tắt và vai trò của tự thực được thảo luận theo hướng tiếp cận quá trình.
Đa dạng vi khuẩn trong các mẫu môi trường thường được đánh giá bằng cách sử dụng các trình tự gen 16S rRNA (16S) khuếch đại bằng PCR. Tuy nhiên, sự đa dạng được cảm nhận có thể bị ảnh hưởng bởi việc chuẩn bị mẫu, việc lựa chọn mồi và hình thành các sản phẩm khuếch đại 16S chimeric. Chimera là các sản phẩm lai tạo giữa nhiều trình tự gốc có thể bị diễn giải sai là các sinh vật mới, do đó làm gia tăng sự đa dạng rõ ràng. Chúng tôi đã phát triển một công cụ phát hiện chimera mới gọi là Chimera Slayer (CS). CS phát hiện các chimera với độ nhạy lớn hơn so với các phương pháp trước đây, hoạt động tốt trên các trình tự ngắn như những trình tự được tạo ra bởi máy giải trình tự Genome của 454 Life Sciences (Roche), và có thể mở rộng đến các bộ dữ liệu lớn. Bằng cách so sánh hiệu suất CS với các trình tự từ một hỗn hợp DNA kiểm soát của các sinh vật đã biết và một tập hợp chimera được mô phỏng, chúng tôi cung cấp những hiểu biết về các yếu tố ảnh hưởng đến sự hình thành chimera như sự phong phú của trình tự, mức độ tương đồng giữa các gen 16S và điều kiện PCR. Các chimera được phát hiện có xu hướng hình thành lại giữa các lần khuếch đại độc lập và góp phần vào những nhận thức sai lệch về sự đa dạng của mẫu cũng như việc nhận dạng sai các loại mới, với các loài ít phong phú cho thấy tỷ lệ chimera vượt quá 70%. Các trình tự metagenomic không mục tiêu của cộng đồng mô phỏng của chúng tôi dường như không có chimera 16S, hỗ trợ một vai trò của metagenomics trong việc xác nhận các sinh vật mới được phát hiện trong các khảo sát trình tự mục tiêu.
Các ngưng tụ căng thẳng là các cấu trúc RNA-protein (RNP) không có màng bao bọc hình thành khi sự khởi đầu dịch mã bị giới hạn và chứa một cấu trúc hai pha với các cấu trúc lõi ổn định được bao quanh bởi một lớp ít tập trung hơn. Thứ tự của quá trình lắp ráp và giải phóng của hai cấu trúc này vẫn chưa được biết rõ. Phân tích theo thời gian của quá trình lắp ráp ngưng tụ cho thấy rằng việc hình thành lõi là một sự kiện sớm trong lắp ráp ngưng tụ. Quá trình giải phóng ngưng tụ căng thẳng cũng là một quá trình theo từng bước với sự phân tán lớp bao xung quanh, tiếp theo là sự làm sạch lõi. Các can thiệp làm thay đổi sự tách pha lỏng-lỏng (LLPS) do các vùng protein không có cấu trúc cố định (IDR) của các protein liên kết RNA trong ống nghiệm có tác động ngược lại đến việc lắp ráp ngưng tụ căng thẳng trong sống. Xem xét tổng thể, những quan sát này cho rằng các ngưng tụ căng thẳng được lắp ráp thông qua một quá trình đa bước, bắt đầu bằng việc lắp ráp ổn định của các mRNP không được dịch mã vào các cấu trúc lõi, điều này có thể cung cấp nồng độ địa phương cao đủ để cho phép một LLPS địa phương được điều khiển bởi các IDR trên các protein liên kết RNA.
Giải trình tự metagenomic có thể được sử dụng để phát hiện bất kỳ tác nhân gây bệnh nào bằng cách sử dụng giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) không thiên lệch, không cần khuếch đại cụ thể cho trình tự. Bằng chứng khái niệm đã được chứng minh trong các ổ dịch bệnh truyền nhiễm không rõ nguyên nhân và ở những bệnh nhân nghi ngờ nhiễm trùng nhưng có kết quả xét nghiệm âm tính với các phương pháp truyền thống. Các bài kiểm tra NGS metagenomic có tiềm năng lớn để cải thiện chẩn đoán bệnh truyền nhiễm, đặc biệt là ở những bệnh nhân có hệ miễn dịch yếu và bệnh nhân nặng.
Ve được coi là vector quan trọng nhất của các tác nhân gây bệnh ở động vật nuôi và động vật hoang dã. Ve bò,
Dữ liệu thô từ bTEFAP đã được sàng lọc và cắt tỉa dựa trên điểm chất lượng và nhóm vào các bộ mẫu cá nhân. Các loại vi khuẩn được xác định ở cấp độ loài bao gồm
Báo cáo này đại diện cho khảo sát đầu tiên về hệ vi khuẩn trong ve bò sử dụng các phương pháp phân tử không dựa trên nuôi cấy. Việc so sánh kết quả của chúng tôi với các khảo sát vi khuẩn trước đó cung cấp một chỉ báo về sự biến đổi địa lý trong các tập hợp vi khuẩn liên quan đến
Việc kết hợp chặt chẽ các alen HLA giữa người cho và người nhận là điều kiện tiên quyết quan trọng cho sự thành công của việc cấy ghép tế bào gốc huyết học không liên quan. Để tăng khả năng tìm kiếm người cho không liên quan, các cơ sở dữ liệu đã tuyển dụng hàng trăm ngàn tình nguyện viên mỗi năm. Nhiều cơ sở dữ liệu có nguồn lực hạn chế đã phải tìm kiếm một sự thỏa hiệp giữa chi phí và độ phân giải cũng như phạm vi của việc phân loại cho những người cho mới được tuyển dụng trong quá khứ. Do đó, chúng tôi đã tận dụng những cải tiến gần đây trong công nghệ giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) để phát triển một quy trình với chi phí thấp và độ phân giải cao cho phân loại HLA.
Phần lớn quy trình sản xuất nhiên liệu sinh học thế hệ thứ hai là quá trình phân giải enzym lignocellulose từ sinh khối thành đường có thể lên men. Nhiều loại nấm sản xuất enzym có khả năng phân giải lignocellulose và các hỗn hợp enzym từ một số loài nấm, bao gồm những loài được nghiên cứu kỹ lưỡng như
Trong
•
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 10